L'île du Pokémon géant

Nos héros et Team Rocket ne survivent au naufrage que pour faire face à une situation tout aussi périlleuse. Ils sont attaqués par un féroce Gyarados qui se multiplie rapidement. Soudainement une tornade emporte et disperse tout ce monde sur une île étrange habitée par un Pokémon géant. Ash perd Pikachu et les PokéBalls contenant Charmander, Squirtle et Bulbasaur. Jessie et James, à l'autre bout de l'île, cherchent aussi leur Pokémon. Ont-ils tous perdus le Nord?